Molecular Simulation Approaches to Solubility
下载：https://static.msi.umn.edu/rreports/2006/54.pdf
很好的教程。详细讨论了溶解度、溶剂化自由能的区别，以及分子动力学模拟自由能的几种方法的来源和区别。
特别是关于两类最基本的自由能模拟方法，热力学积分方法，和微扰法。
热力学积分是构造热力学路径和参数λ，当参数λ从０变到１，状态则从初态到末态。其中每一个态的模拟，其哈密顿都包含参数λ。
而微扰法的重点是计算两个极其接近的状态之间的自由能差。为什么要极其接近呢，因为要在无微扰的０态采样，然后计算微扰态与无微扰态之间的哈密顿之差的统计平均，这里实际假定了微扰前后你的可及构象空间完全重叠，否则这个统计平均就没有意义了。
这两种方法其实很类似。
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